PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带 与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:
1、引物与靶序列不wan全互补、或引物聚合形成二聚体。
2、Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。其次,是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶的量过多有时也会出现非特异性扩增。
其对策有:
①必要时,重新设计引物。
②减低酶的量或调换另一来源的酶。
③降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。
④适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸,也叫两步法)。